從免疫的觀點來看，由于其對身體的免疫作用，不應隨便將扁桃體摘除。扁桃體肥大是正常生理現象，如果肥大但未影響呼吸和吞咽，沒有產生較重的臨床表現，不應摘除。因為切除后可能會影響局部的免疫反應，降低身體抗感染的能力。如果扁桃體炎反復發作，妨礙呼吸和吞咽，引起風濕及腎炎等疾病時，應及時切除。一般扁桃體切除術應在四歲以后進行，而且要等炎癥消退后兩周至三周切除比較適宜。但若發作過于頻繁，不能久等，可考慮在發作消退后數天施行手術。